with all due respect

恐縮ですが / 差し出がましいようですが

これは非常に丁寧でありながら、皮肉な意味合いを含むこともあるフレーズで、反対意見を述べる前に敬意を示すために使われます。ジェイクは自分が助けを必要としないと言いたいが、上司に直接反抗したくないという気持ちを表しています。